| キャラクター | 出現条件 |
| サムス | ・最初から使える |
| ゼロスーツサムス | ・サムスで最後の切り札を使う ・キャラ選択画面でシールドボタンを押したままゲームを始める ・戦闘中でアピールの↑↓↑を素早く入力する |
| タイトル | 出展 |
| メインテーマ（メトロイド） | メトロイド |
| エンディグ（メトロイド） | メトロイド |
| ノルフェア | メトロイド |
| 宇宙戦士 サムス アランのテーマ | スーパーメトロイド |
| vs.リドリー | スーパーメトロイド |
| vs.パラサイトクイーン | メトロイドプライム |
| オープニング / メニュー（メトロイドプライム） | メトロイドプライム |
| Sector1 | メトロイド フュージョン |
| vs.メタリドリー | メトロイドプライム |
| マルチプレイ（メトロイドプライム2） | メトロイドプライム２ ダークエコーズ |
| 名前 | 出展 | 獲得条件 |
| サムス | メトロイド | サムスで「シンプル」クリア |
| ゼロレーザー | 大乱闘スマッシュブラザーズX | サムスで「オールスター」クリア |
| ゼロスーツサムス | メトロイド ゼロミッション | ゼロスーツサムスで「シンプル」クリア |
| パワードスーツ装着 | 大乱闘スマッシュブラザーズX | ゼロスーツサムスで「オールスター」クリア |
| スクリューアタック改 | メトロイド | |
| メトロイド | メトロイド | |
| リドリー | メトロイド | スマッシュプレートを使う |
| メタリドリー | メトロイドプライム | スマッシュプレートを使う |
| サムス（フュージョン） | メトロイド フュージョン | |
| ノーマルスーツ | メトロイド | |
| バリアースーツ | スーパーメトロイド | |
| グラビティスーツ | スーパーメトロイド | |
| ダークスーツ | メトロイドプライム２ ダークエコーズ | |
| ダークサムス | メトロイドプライム２ ダークエコーズ | |
| カンデン | メトロイドプライム ハンターンズ | |
| スパイア | メトロイドプライム ハンターンズ | |
| ウィーヴェル | メトロイドプライム ハンターンズ | |
| ノクサス | メトロイドプライム ハンターンズ | |
| トレース | メトロイドプライム ハンターンズ | |
| サイラックス | メトロイドプライム ハンターンズ | |
| ルミナス | メトロイドプライム２ ダークエコーズ | |
| シーゴース | メトロイドプライム | |
| スペースパイレーツ | メトロイドプライム | |
| パラサイトクイーン | メトロイドプライム | |
| メトロイドプライム（ヘッド） | メトロイドプライム | |
| メトロイドプライム（スパイダー） | メトロイドプライム | |
| スターシップ | スーパーメトロイド |
| 名前 | 出展 | 効果 | 制限 |
| エネルギータンク | メトロイド | 【エネルギー】攻撃↑12 | サムス、ゼロスーツサムス |
| リドリー | メトロイド | 【暗黒】攻撃↑30 | ガノンドロフ |
| サムス | メトロイド | 【必殺ワザ：飛び道具系】 攻撃↑15 |
サムス、ゼロスーツサムス |
| 超人族の像 | メトロイドⅡ | 【波導】攻撃↑25 | ルカリオ |
| ゼーベス星人 | スーパーメトロイド | 【暗黒】攻撃↑13 | ガノンドロフ |
| ゼーベス星人 | メトロイド フュージョン | 【腕】攻撃↑5 | |
| スターシップ | メトロイド フュージョン | 【武器】攻撃↑9 | サムス、ゼロスーツサムス |
| サムス | メトロイド フュージョン | 【電撃】耐性↑16 | サムス、ゼロスーツサムス |
| ゼロスーツサムス | メトロイド ゼロミッション | 【足】攻撃↑9 | サムス、ゼロスーツサムス |
| 走るゼロスーツサムス | メトロイド ゼロミッション | 【武器】攻撃↑25 | サムス、ゼロスーツサムス |
| クレイド | メトロイド ゼロミッション | 【頭】攻撃↑33 | |
| メトロイド | メトロイド ゼロミッション | 【電撃】攻撃↑20 | サムス、ゼロスーツサムス |
| マザーブレイン | メトロイド ゼロミッション | ひるみにくさ↑144 | |
| ダークスーツサムス | メトロイドプライム２ ダークエコーズ | 【投げ】攻撃↑16 | |
| ウォーリアイング | メトロイドプライム２ ダークエコーズ | 【かみつき】攻撃↑20 | ヨッシー、ワリオ ポケモントレーナー、ウルフ |
| サムス | メトロイドプライム２ ダークエコーズ | 【爆発】攻撃↑18 | |
| スターシップ | メトロイドプライム２ ダークエコーズ | 【爆発】攻撃↑5 | |
| ルミナス | メトロイドプライム２ ダークエコーズ | 【切り裂き】耐性↑9 | |
| ダークサムス | メトロイドプライム２ ダークエコーズ | 【打撃】耐性↑20 | サムス、ゼロスーツサムス |
| トルーパー | メトロイドプライム２ ダークエコーズ | スーパースコープを もっていく |
|
| スペシャルトークン | メトロイドプライム ピンボール | 【腕】攻撃↑6 | サムス、ゼロスーツサムス |
| モフーボール | メトロイドプライム ピンボール | 【武器】攻撃↑6 | サムス、ゼロスーツサムス |
| メトロイド | メトロイドプライム ピンボール | 【氷結】攻撃↑18 | |
| カンデン | メトロイドプライム ハンターンズ | 【切り裂き】耐性↑15 | |
| スターシップ | メトロイドプライム ハンターンズ | ふっとばし↑22 | |
| ウィーヴエル | メトロイドプライム ハンターンズ | ビームソードを もっていく |